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[其他] 宏基因组pcoa分析新人求指导

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发表于 2018-6-19 22:08:52 | 显示全部楼层 |阅读模式
网上出的pcoa分析的教程一般都是16s的,需要otu表和进化树.tre文件。但是在做宏基因组分析时并没有生成这两种文件,希望有做过宏基因组pcoa分析的大神能给些指导,在此感激不尽!
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发表于 2018-9-13 12:03:23 | 显示全部楼层
我想,你的问题是没有认真去理解16S的pcoa分析的教程,所以不懂得如何去迁移。
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 楼主| 发表于 2018-9-17 09:59:49 | 显示全部楼层
ydchen 发表于 2018-9-13 12:03
我想,你的问题是没有认真去理解16S的pcoa分析的教程,所以不懂得如何去迁移。 ...

现在我所获得的宏基因组otu表是nr比对后利用megan软件生成的,速度比较一般,然后再用r语言进行pcoa分析的。
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