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illumina snp 芯片原始数据转换基因型矩阵问题

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发表于 2018-8-13 10:04:45 | 显示全部楼层 |阅读模式
格式内容见截图,通常snp芯片人家给的都是直接可用的基因型矩阵文件,我拿到的文件有问题,要来了原始文件;那么问题来了,中间的转化过程一窍不通,求前辈们指点下!尝试了用illumina官网的Mitrebox转化,失败告终……

50k snp 芯片头和内容

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 楼主| 发表于 2018-8-13 13:48:47 | 显示全部楼层
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发表于 2019-9-4 22:39:25 | 显示全部楼层
您好,请问您的这个问题解决了吗?我也需要处理Infinium Global Screening Array(GSA)
GSA芯片数据
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 楼主| 发表于 2020-10-20 15:46:53 | 显示全部楼层
13897668153 发表于 2019-9-4 22:39
您好,请问您的这个问题解决了吗?我也需要处理Infinium Global Screening Array(GSA)
GSA芯片数据 ...

搞定了,有现成的如软件
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发表于 2021-7-16 10:46:52 | 显示全部楼层
大裤衩 发表于 2020-10-20 15:46
搞定了,有现成的如软件

什么软件,可以透露一下吗
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