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[variation-calling] SNP 附近的SNP过滤 -- 求脚本

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发表于 2018-12-16 19:59:09 | 显示全部楼层 |阅读模式
请教各位大神,最近在做SNP过滤,想要把vcf文件中附近50bp有SNP的SNP过滤掉,有没有什么软件,或者脚本可以实现?
我知道bcftools 可以吧INDEL附近的SNP去掉,但是不知道有没有过滤软件可以实现SNP的过滤?
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发表于 2019-1-17 20:42:59 | 显示全部楼层

回帖奖励 +3 金钱

简书上有几个关于 SNP的过滤 几个帖子可以看看,在下面留言问问
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