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求助!如何使用vcf文件中的SNP数据计算居群杂合度

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发表于 2019-1-18 10:12:54 | 显示全部楼层 |阅读模式
如题。我分别使用vcftools和plink中 -het 命令来计算vcf文件中每个个体的杂合度,可是得到的结果都如下图,请问期望杂合度(He)和观察杂合度(Ho)该如何计算?近交系数(F)为什么会出现负数?

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