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[mRNA-seq] 第一次分析转录组数据,请问怎么挑选差异表达基因

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发表于 2019-2-28 21:41:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
第一次分析转录组数据,请问怎么挑选差异表达基因,有得到DEGs的GO、KEGG 和 rich GO、rich KEGG,但是怎么从中挑选出我需要的差异表达基因,新手一个,请各位大大赐教




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发表于 2019-3-7 09:53:02 | 显示全部楼层
转录组数据是公司给你测的,还是ncbi下载的?
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 楼主| 发表于 2019-4-1 10:10:22 | 显示全部楼层
xiuwei001 发表于 2019-3-7 09:53
转录组数据是公司给你测的,还是ncbi下载的?

公司测的
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发表于 2019-10-10 08:46:22 | 显示全部楼层
clusterprofiler软件有个heatmap图,对应基因和GO terms 热图关系,要公司给这个图,直观明了看到注释情况喽,但是,个人觉得,做转录组前一般内心都要有个预判,所有照着预判去找,它不一定要出现在最显著的位置。
苛求远离完美
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