为什么用R语言根据GSE号下载得不到表达矩阵，急求！

Puala

有个很急的问题,我根据GSE号GSE35156，我不管是在GEO数据库直接下载Series Matrix File(s)还是在R语言代码下载它的表达矩阵都为空，是怎么回事？？？
那么这种情况下，我该怎么得到它的表达矩阵

kylinson

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GPL11154
GPL11154是高通量测序，不是芯片数据，所以作者没有上传Series Matrix File作为表达矩阵

Puala

kylinson 发表于 2019-3-11 19:34
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GPL11154
GPL11154是高通量测序，不是芯片数据，所以 ...

所以我是不是要下载它的原始数据raw_data？然后自己去处理原始数据，最后得到它的Hi-C交互矩阵或者热图？

No.4

请问你的问题解决了吗？我现在也是需要这个里面的基因表达数据，IMR90的，但不知道该怎么获取

Puala

No.4 发表于 2019-4-14 10:12
请问你的问题解决了吗？我现在也是需要这个里面的基因表达数据，IMR90的，但不知道该怎么获取 ...

没有呢，感觉很麻烦，数据量很大，下载就很麻烦，还得自己处理成矩阵