为什么用R语言根据GSE号下载得不到表达矩阵，急求！

Puala · 发表于 2019-3-6 20:36:48

有个很急的问题,我根据GSE号GSE35156，我不管是在GEO数据库直接下载Series Matrix File(s)还是在R语言代码下载它的表达矩阵都为空，是怎么回事？？？
那么这种情况下，我该怎么得到它的表达矩阵

kylinson · 发表于 2019-3-11 19:34:21

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GPL11154
GPL11154是高通量测序，不是芯片数据，所以作者没有上传Series Matrix File作为表达矩阵

Puala · 发表于 2019-3-12 17:05:20

kylinson 发表于 2019-3-11 19:34
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GPL11154
GPL11154是高通量测序，不是芯片数据，所以 ...

所以我是不是要下载它的原始数据raw_data？然后自己去处理原始数据，最后得到它的Hi-C交互矩阵或者热图？

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