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[其他] 为什么用R语言根据GSE号下载得不到表达矩阵,急求!

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发表于 2019-3-6 20:36:48 | 显示全部楼层 |阅读模式
有个很急的问题,我根据GSE号GSE35156,我不管是在GEO数据库直接下载Series Matrix File(s)还是在R语言代码下载它的表达矩阵都为空,是怎么回事???
那么这种情况下,我该怎么得到它的表达矩阵


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发表于 2019-3-11 19:34:21 | 显示全部楼层
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GPL11154
GPL11154是高通量测序,不是芯片数据,所以作者没有上传Series Matrix File作为表达矩阵
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 楼主| 发表于 2019-3-12 17:05:20 | 显示全部楼层
kylinson 发表于 2019-3-11 19:34
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GPL11154
GPL11154是高通量测序,不是芯片数据,所以 ...

所以我是不是要下载它的原始数据raw_data?然后自己去处理原始数据,最后得到它的Hi-C交互矩阵或者热图?
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