搜索
查看: 166|回复: 0

[CHIP-seq] 有关chip-seq在重复区域进行peak-calling的问题

[复制链接]

5

主题

10

帖子

166

积分

注册会员

Rank: 2

积分
166
发表于 2019-7-19 10:29:58 | 显示全部楼层 |阅读模式
一般常规来说,chip-seq分析在mapping的时候,都会选取unique reads以及去掉duplicates。但是如果我想找基因组上一些重复区域,比如LINE还有SINE之类的上面的组蛋白修饰,去掉这些多重比对,以及重复reads又不太合适。有什么比较好的方法推荐吗?



上一篇:求助帖:GATK的Haplotypecaller流程检测不到低频突变?
下一篇:克 山 县 哪 里 能 找 到 小 姐 電 話
回复

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|手机版|小黑屋|生信技能树 ( 粤ICP备15016384号  

GMT+8, 2019-8-23 17:58 , Processed in 0.030775 second(s), 28 queries .

Powered by Discuz! X3.2

© 2001-2013 Comsenz Inc.