搜索
查看: 2793|回复: 4

问题待解决1-有哪些拿来就用的差异分析数据库?

[复制链接]

23

主题

62

帖子

484

积分

管理员

Rank: 9Rank: 9Rank: 9

积分
484
发表于 2016-10-6 10:32:49 | 显示全部楼层 |阅读模式
这个系列以后会成为导航帖,暂时还处于建设状态,会包括全站以及全网跟该主题相关的资料)
大家好,我是果子,是这个版块的版主。我是一名搞科研的临床医生,没有足够的精力去系统学习生物信息学,
但是生信又是我们生活中不可或缺的,设计课题,发文章,升职称等等,无法回避
思前想后,我们在生信领域绕不开的三个问题大概是这样的:
1.如何找到差异分子作为课题的原始Idea?
2.如何利用生存分析筛选出重要的差异分子?
3.如何利用数据库挖掘出可能的分子机制?

临床医生只要解决这三个问题就基本OK了。
我暂时不能赞同纯粹依靠分析数据去发文章这件事,
做生信我们搞不过专业的,
做实验我们搞不过基础的,
如何生存下去,我估计
只能依靠临床背景发现临床问题,
利用生信把临床问题转化成科研问题
再依靠实验和生信结合挖掘机制。

你们有什么好的想法,可以给我支个招。

好了第一个问题就是:
有哪些数据库可以找出差异分子并拿来就用?
GEO
Oncomine
TCGA相关数据库
期待你的回复
见识决定高度。





上一篇:要充分了解你的测序数据--论QC的重要性
下一篇:问题待解决2-如何利用TCGA数据库来找出差异分子?
回复

使用道具 举报

634

主题

1182

帖子

4030

积分

管理员

Rank: 9Rank: 9Rank: 9

积分
4030
发表于 2016-10-6 12:23:48 | 显示全部楼层
NCBI的GEO主页搜索功能支持找出差异分子并拿来就用,你可以试试看
你这个问题很复杂,需要打赏,请点击 http://www.bio-info-trainee.com/donate 进行打赏,谢谢
回复 支持 反对

使用道具 举报

23

主题

62

帖子

484

积分

管理员

Rank: 9Rank: 9Rank: 9

积分
484
 楼主| 发表于 2016-10-6 15:36:32 | 显示全部楼层
Jimmy 发表于 2016-10-6 12:23
NCBI的GEO主页搜索功能支持找出差异分子并拿来就用,你可以试试看

好的,这些拿来就用的数据库会一一涉及,论坛里到处都是你的帖子,哈哈!
回复 支持 反对

使用道具 举报

634

主题

1182

帖子

4030

积分

管理员

Rank: 9Rank: 9Rank: 9

积分
4030
发表于 2016-10-6 22:02:52 | 显示全部楼层
果子 发表于 2016-10-6 15:36
好的,这些拿来就用的数据库会一一涉及,论坛里到处都是你的帖子,哈哈! ...

恰好空余了一个月,所以才有空打理论坛,哈哈,做好表率嘛,到了澳门大学,我就开潜心科研了,大家一起加油哈
你这个问题很复杂,需要打赏,请点击 http://www.bio-info-trainee.com/donate 进行打赏,谢谢
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

5

帖子

75

积分

注册会员

Rank: 2

积分
75
发表于 2017-2-15 23:23:38 | 显示全部楼层
我还等着学习呢,楼主,求更新
回复 支持 反对

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|手机版|小黑屋|生信技能树    

GMT+8, 2019-3-25 00:13 , Processed in 0.040693 second(s), 29 queries .

Powered by Discuz! X3.2

© 2001-2013 Comsenz Inc.