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Blast2go具体操作:

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发表于 2016-10-19 14:19:27 | 显示全部楼层 |阅读模式
请安装jdk , java 1.6 可运行;1.8的也可以。
1.导入结果(从uniprotNCBI序列)
2.png
2.Blast结果(可以在线比对也可以本地比对,一般保存用xml格式)
1.png
3.Mapping结果(与网络速度有关系有时候不能mapping,过几天再试)
3.png
4.Annotation结果(打分目的是评价注释的结果可靠和符合我们预设分数)
4.png
最后导也结果。
绘制GO level2 柱形图(ggplot2或华大基因wego当然你也可以自己写脚本)
5.png
用topGO做GO富集分析(bioconductorR语言)

下面是blast2go颜色:
6.png

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发表于 2016-10-21 15:34:44 | 显示全部楼层
谢谢分享。增长见识了,期待更多分享。
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发表于 2016-11-1 20:41:42 | 显示全部楼层
佩服
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