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[lncRNA-seq] 转录组数据分析硬件配置

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发表于 2016-10-22 14:12:42 | 显示全部楼层 |阅读模式
各位老师好!
首先非常感谢网站上提供的非常有用的信息和资源。
我想对公司给的有参转录组raw read进行数据过滤、比对、差异基因分析、以及KEGG、GO等分析,想组装一台台式机,什么样的配置可以满足?能不能提供一下相关硬件配置?

非常感谢!



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发表于 2016-10-22 14:51:24 | 显示全部楼层
如果只有一组数据,8核CPU+16G内存+500G硬盘是可以胜任分析工作的,如果后续会有大量数据建议找服务器来做

比对分析相对耗时较长,参考时间
1G参考基因组,8核CPU,16G内存,4-6G 数据每小时
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 楼主| 发表于 2016-10-22 15:06:46 | 显示全部楼层
dongye 发表于 2016-10-22 14:51
如果只有一组数据,8核CPU+16G内存+500G硬盘是可以胜任分析工作的,如果后续会有大量数据建议找服务器来做
...

谢谢您!
不好意思,刚刚忘记写上了:我有两组数据(实验组和对照组),每组三个重复,每个样品10G数据量
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发表于 2016-10-23 17:24:13 | 显示全部楼层
jianjian1105 发表于 2016-10-22 15:06
谢谢您!
不好意思,刚刚忘记写上了:我有两组数据(实验组和对照组),每组三个重复,每个样品10G数据量 ...

1天和3天的差别、在买电脑这件事里应该可以忽略的吧
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 楼主| 发表于 2016-10-24 11:40:10 来自手机 | 显示全部楼层
谢谢您!
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