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配对末端标签测序分析染色质相互作用(ChIA-P...

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发表于 2016-10-29 21:00:11 | 显示全部楼层 |阅读模式
配对末端标签测序分析染色质相互作用 (ChIA-PET)技术是一项在全基因组范围内分析远程染色质相互作用的技术。它把染色质免疫沉(ChIP)技术、染色质邻近式连接技术、配对末端标签(PET)技术和新一代测序技术融为一体,在基因组三维折叠和套环状态下分析基因表达和调控。该技术可实时捕获全基因组范围内参与复制、转录过程的蛋白质因子结合位点以及结合位点间的相互作用,这对于阐明基因调控和疾病发生机制具有重大意义。ChIA-PET技术应用了PET测序技术的基本原理。PET测序技术的独特之处在于构建配对末端测序模板。从目的DNA片段两个末端提取短标签并将它们配对构成一个PET,对PET进行高通量测序,利用标签序列定位目的DNA片段在基因组中的位置。ChIA-PET技术是利用PET测序技术研究免疫沉淀后邻近式连接的DNA片段,以得到染色质相互作用的技术。文献链接:http://science.sciencemag.org/co ... cience.aad9024.full






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