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[linux] 小白linux入门基础

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发表于 2017-1-14 10:52:18 | 显示全部楼层 |阅读模式
linux系统是生信的必备技能,其重要性无需多言。但是在小白的学习中,总是感觉无从下手以及入门难度特别大,最后导致很多人浅尝辄止,出师未捷身先死。结合我自己的学习过程,我觉得导致这个问题的最主要的原因就是没有一个合适的学习体系。多数linux教程都是偏向计算机方向的,对生物人不够好。另外内容方面又有大量生信入门并不需要的东西,更加加重了学习难度。
jimmiy的帖子:http://www.bio-info-trainee.com/1661.html 给我们列出了一个很好的学习大纲,确立的我们小白学习的目标。我根据自己的学习经验,给同伴们补充一点具体的学习材料,原文发在知乎专栏,这里做全文转载。
另外刚刚看到[color=rgb(0, 0, 0) !important]bioinfo何婷的一篇帖子里(http://www.biotrainee.com/thread-146-1-1.html)推荐的《生物人的电脑教室》,感觉也很不错,我还没有找到,找到后与大家共同学习。

作者:青山屋主
链接:https://zhuanlan.zhihu.com/p/24863136
来源:知乎
著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

一、用哪种linux系统?
有服务器的就不用纠结了,服务商安的啥就用啥吧。没有就安个CentOS。
没有服务器的小白,在笔记本上安个Bio-linux就很不错。用虚拟机可以,安装双系统也可以。建议都试试,学习本身就是不断折腾的过程,不折腾就没收获。安装Bio-linux的过程可以参考我的博客:Bio-linux系统的安装_青山屋主_新浪博客Bio-linux与win7的双系统安装_青山屋主_新浪博客安装Bio-Linux8_青山屋主_新浪博客
Bio-linux系统的优点是已经安装好了生物信息分析常用的软件和包,可以跳过繁琐的软件安装过程从而专注于软件的使用和数据分析本身,适合于快速掌握“战略”能力。
初学者也可以选择CentOS系统,将其安装在台式或者笔记本上。CentOS的优点在于它本身就是许多服务器的系统,因此学习CentOS的过程也是学习服务器系统配置的一个过程,能咋航我更多具体的“战术”的东西。但是缺点就是费时间,大量软件的从头安装以及相应配置的修改都不是初学者能顺利解决的。还有个缺点就是CentOS安装在笔记本上的话会需要很多额外的配置,比如显卡、网卡驱动、输入法、账户设置等等,对初学者很不友好。但是喜欢折腾的同学可以尝试一下:CentOS7 安装时遇到的问题CentOS7安装时的新问题_青山屋主_新浪博客
二、linux系统的基本用法
安装完成后,就到了实际使用的阶段了。如果你是小白,那你肯定对linux一无所知。怎么办?《鸟叔的linux私房菜》太过冗长,看完一遍要好久。所以我推荐小白们直接看Bio-linux自带的使用简介《Introduction to Bio-linux》。薄薄的一本小册子,大概一天就能完全读完。
学完这本小册子就够了吗?
基本够了,生物信息里用到的linux操作你已经基本掌握了,下一步你的重点就该转移到具体的数据分析流程上了。如果还不放心,那就再推荐你学这两门课:
由知友@张旭东 建立,目前免费中。
给大家一张我自己总结的生信常用linux命令总结图:
最后再说一句,新东西学了就得用起来,不然就是白学,不到一星期你就忘光了,所以赶紧操练起来吧!
                  







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