ggplot画GO注释二级分类统计图

dr.tanboyu · 发表于 2017-1-26 01:43:14

在菜鸟团的博客中，老大给了一个样子，http://www.bio-info-trainee.com/771.html 今天我就详细给它来一个补充，细化。

如何实现的呢？下面看代码

游客，如果您要查看本帖隐藏内容请回复

严格来说GO 富集后的图应该是分BP,CC,MF的，我这里因为不是GO富集后的结果，但是思路是一样一样的，只需要在分类填充的地方加上一句就够了，aes()中增加一个aes（fill='你的分类列'）。aes中加入了reorder 按值大小排序；panel.grid.* 这里是去网格线；panel.background去背景线；scale_y_continuous设置Y轴坐标从0,0开始
详细见bobby的博客 http://www.tanboyu.com/ggplot-for-go-enrichment-plot.html

xchromosome · 发表于 2017-2-6 19:31:09

非常感谢！

小布丁大 · 发表于 2017-2-14 09:02:30

不错不错啊

小布丁大 · 发表于 2017-2-14 09:04:39

一般都要再加上显著性的星号

每日生信 · 发表于 2017-3-6 09:18:33

跟愿意分享的牛人学习其乐无穷

jasonxu · 发表于 2017-3-6 10:52:27

不够美观呀

zyj2017 · 发表于 2017-3-8 21:16:40

赞一个。希望我也能尽快学会

Oscarwang · 发表于 2017-3-13 10:32:10

哦。。。。。。。。。。。。。。。。。。。

回首默然 · 发表于 2017-3-15 17:30:29

查看ggplot画G0注释二级分类统计图

回首默然 · 发表于 2017-3-15 17:31:40

谢谢!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!

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ggplot画GO注释二级分类统计图

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