搜索
查看: 1981|回复: 56

ggplot画GO注释二级分类统计图

[复制链接]

10

主题

19

帖子

178

积分

管理员

Rank: 9Rank: 9Rank: 9

积分
178
发表于 2017-1-26 01:43:14 | 显示全部楼层 |阅读模式
在菜鸟团的博客中,老大给了一个样子,http://www.bio-info-trainee.com/771.html  今天我就详细给它来一个补充,细化。

如何实现的呢?下面看代码
游客,如果您要查看本帖隐藏内容请回复

严格来说GO 富集后的图应该是分BP,CC,MF的,我这里因为不是GO富集后的结果,但是思路是一样一样的,只需要在分类填充的地方加上一句就够了,aes()中增加一个aes(fill='你的分类列')。aes中加入了reorder 按值大小排序;panel.grid.* 这里是去网格线;panel.background去背景线;scale_y_continuous设置Y轴坐标从0,0开始
详细见bobby的博客 http://www.tanboyu.com/ggplot-for-go-enrichment-plot.html

本帖子中包含更多资源

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?立即注册

x



上一篇:肿瘤研究里面关心的是nonsynonomous的mutation
下一篇:【直播】我的基因组(三):抽血送样测序
回复

使用道具 举报

1

主题

5

帖子

97

积分

版主

Rank: 7Rank: 7Rank: 7

积分
97
发表于 2017-2-6 19:31:09 | 显示全部楼层
非常感谢!
回复

使用道具 举报

0

主题

3

帖子

33

积分

新手上路

Rank: 1

积分
33
发表于 2017-2-14 09:02:30 | 显示全部楼层
不错不错啊
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

3

帖子

33

积分

新手上路

Rank: 1

积分
33
发表于 2017-2-14 09:04:39 | 显示全部楼层
一般都要再加上显著性的星号
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

3

帖子

75

积分

注册会员

Rank: 2

积分
75
发表于 2017-3-6 09:18:33 | 显示全部楼层
跟愿意分享的牛人学习其乐无穷
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

17

帖子

241

积分

中级会员

Rank: 3Rank: 3

积分
241
发表于 2017-3-6 10:52:27 | 显示全部楼层
不够美观呀
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

3

帖子

89

积分

注册会员

Rank: 2

积分
89
发表于 2017-3-8 21:16:40 | 显示全部楼层
赞一个。希望我也能尽快学会
回复 支持 反对

使用道具 举报

3

主题

15

帖子

160

积分

注册会员

Rank: 2

积分
160
发表于 2017-3-13 10:32:10 | 显示全部楼层
哦。。。。。。。。。。。。。。。。。。。
回复

使用道具 举报

2

主题

11

帖子

105

积分

注册会员

Rank: 2

积分
105
发表于 2017-3-15 17:30:29 | 显示全部楼层
查看ggplot画G0注释二级分类统计图
回复 支持 反对

使用道具 举报

2

主题

11

帖子

105

积分

注册会员

Rank: 2

积分
105
发表于 2017-3-15 17:31:40 | 显示全部楼层
谢谢!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
回复

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|关于我们|手机版|小黑屋|生信技能树    

GMT+8, 2017-8-22 21:00 , Processed in 0.035338 second(s), 32 queries .

Powered by Discuz! X3.2

© 2001-2013 Comsenz Inc.