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[signal-pathway] GO KGEE富集分析 clusterProfiler

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发表于 2020-2-25 20:19:09 | 显示全部楼层 |阅读模式
使用clusterProfiler进行kegg富集分析
首先将基因名转换成了ENTREZID
然后进行KEGG分析
结果不能进行
显示NO gene can be mapped


已经转换基因名了,显示的基因名也是ENTREZID格式的
怎么还不行呢?

百思不得解~~~

01.jpg
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发表于 2020-3-6 15:24:21 | 显示全部楼层
你代码哪里来的,删掉  keyType那个参数就好了
你这个问题很复杂,需要打赏,请点击 http://www.bio-info-trainee.com/donate 进行打赏,谢谢
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 楼主| 发表于 2020-3-15 14:59:27 | 显示全部楼层
Jimmy 发表于 2020-3-6 15:24
你代码哪里来的,删掉  keyType那个参数就好了

代码出处:https://www.jianshu.com/p/feaefcbdf986
删掉那个参数,还是不行
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 楼主| 发表于 2020-3-20 08:08:49 | 显示全部楼层
更新:
用RGui可以进行的,没有问题的
不过还是不知道这是为什么
~~~~
不说神奇了,毕竟,神奇来源于无知
······
可是,为什么啊

微信图片_20200320080359.jpg
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