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[mRNA-seq] 转录组问题求助

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发表于 2020-4-3 14:02:04 | 显示全部楼层 |阅读模式
微信图片_20200403135757.png
请问为什么我的fastq-dump用不了--split-3参数呀!有大神可以解答吗?
我用的命令是fastq-dump --split-3 SRR1497777.sam



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发表于 2020-4-3 20:17:19 | 显示全部楼层
本帖最后由 zd200572 于 2020-4-3 20:35 编辑

是这个选项改名了吗?
https://github.com/ncbi/sra-tools/issues/308
https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/T ... it_doc&f=fastq-dump
欢迎交流!
https://github.com/zd200572/
https://jiawen.zd200572.com
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发表于 2020-4-14 01:14:22 | 显示全部楼层
已经提示很清楚了,其实是fastq-dump 参数变化,新版的sratools 已经没有--split-3这个参数。遇到这种情况,就看最新的handbook。
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