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[tutorial] ChEMBL数据库如何用IC50筛选以及其他一些问题

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发表于 2020-4-28 09:43:40 | 显示全部楼层 |阅读模式
近期宅家研习往届博士师兄的毕业论文,非科班出生的生信小白看得是头晕眼花。想向各位大神求助几个问题。(小白首问,如有分类错误,版主手下留情

Q1:文章中提及“ChEMBL数据库检索Ischemia得到对抗缺氧损伤表型具有保护作用的化合物”。求问各位大佬,仅仅以“Ischemia"为关键词就能检索得到缺氧保护的化合物吗?不会得到诱导缺氧的化合物吗?
Q2:文章提及用IC50对ChEMBL数据库检索的结果进行筛选,但我并没有在ChEMBL数据库中找到IC50这个选项(如下图),请问是我的操作有误吗?

小白提问,求大神解答 ChEMBL.png
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 楼主| 发表于 2020-4-28 10:26:08 | 显示全部楼层
本帖最后由 柏拉只是图 于 2020-4-28 10:30 编辑

Q1:我再indication里检索,不知道行不行,检索出来的结果比文献里的多很多,不知道筛选以后会不会好
关于Q2,找到了IC50,在bioactibities下面,可是下载以后的CSV文件里,没有把IC50单独列出来,没办法筛选 求大神解答
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