搜索
查看: 217|回复: 2

[coding] 如何使用pandas/numpy库对两列‘绑定’数据列进行排序?

[复制链接]

3

主题

4

帖子

176

积分

注册会员

Rank: 2

积分
176
发表于 2020-5-5 21:45:36 | 显示全部楼层 |阅读模式
现在想使用pandas对每两列‘绑定’列的数据进行排序,一列是geneID,一列是TPM值。根据基因的TPM值按照降序进行排列。

比如图中这个测试文件,第一行排序后应该为:gene4  17  gene3  8.8  gene1  0.7  gene2  0.5   即将每行的基因根据其TPM值进行排序
像这样使用pandas或者numpy对整个文件进行 行内排序,求大神帮助!!
用R也可以!!多谢!

pandas_test.png
回复

使用道具 举报

3

主题

4

帖子

176

积分

注册会员

Rank: 2

积分
176
 楼主| 发表于 2020-5-5 21:53:50 | 显示全部楼层

如何使用pandas/numpy库对两列‘绑定’数据列进行排序?

现在想使用pandas对每两列‘绑定’列的数据进行排序,一列是geneID,一列是TPM值。根据基因的TPM值按照降序进行排列。
比如下面图中这个测试文件,第一行排序后应该为:gene4  17  gene3  8.8  gene1  0.7  gene2  0.5   即将每行的基因根据其TPM值进行排序
像这样使用pandas或者numpy对整个文件进行 行内排序,求大神帮助!!
用R也可以,最下面附上测试数据文件。

pandas_test.png

pands_sort_test.rar

6.21 KB, 下载次数: 5

测试数据

回复 支持 反对

使用道具 举报

1

主题

3

帖子

25

积分

新手上路

Rank: 1

积分
25
发表于 2020-5-14 07:32:47 | 显示全部楼层
回复 支持 反对

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|手机版|小黑屋|生信技能树 ( 粤ICP备15016384号  

GMT+8, 2020-6-6 09:07 , Processed in 0.041510 second(s), 26 queries .

Powered by Discuz! X3.2

© 2001-2013 Comsenz Inc.