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分享个人工具-nanopore下机比对结果可视化工具

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发表于 2020-5-21 01:41:54 | 显示全部楼层 |阅读模式
作者前一段时间一直在摸索long reads的数据,经历了对好几次对不同数据的描述分析,总结了一份可视结果的代码。其主要是对下机数据的fastq文件以及经过比对后的bam文件进行可视化的summary。
字体图片大小经过调整,方便直接用到幻灯片里面。

目前可以实现的功能如下:




示例:


并且该工具将一直保持更新。希望大家尝试使用,减少重复性工作。有什么需要拓展的功能,也可以联系我。
附上工具网址:
https://github.com/renzilin/visual_nanoReads

region_MAPQ_dist.png
region_length_dist.png
region_AS_dist.png
region_align_dist_logscale.png
region_align_dist.png
align_log_count_dist.png
align_count_dist.png
align__length_dist.png
Annotation 2020-05-20 133718.png



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发表于 2020-5-22 08:38:39 | 显示全部楼层
赞赞赞!
欢迎交流!
https://github.com/zd200572/
https://jiawen.zd200572.com
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发表于 2020-5-22 23:47:29 | 显示全部楼层
非常棒!!!
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发表于 昨天 21:33 | 显示全部楼层
厉害且无私!
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