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[其他] miRNA的基因长度信息在哪里可以找到。

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发表于 2020-8-26 22:10:35 | 显示全部楼层 |阅读模式
我是生信分析初学者,我下载TCGA中miRNA的数据后得到是count值,并利用miRbases数据库中的信息堆砌进行注释。然后我想把这些count数据进行TPM标准化,可是我不知道从哪里可以找到miRNA的长度信息,所以就不能继续下去了,恳求大神指点。
ps:我有去gencode数据库去下载‘gencode.v22.annotation.gff3’,可是这里面的miRNA的一些数据有限,不能得到所以的miRNA的长度信息
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 楼主| 发表于 2020-8-26 23:53:57 | 显示全部楼层
我已经知道哪里有了。在miRBase数据库的download中有个hsa.gff3文件,里面有长度数据。
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