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[其他] R DESeq2

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新手上路

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发表于 2020-11-9 18:43:16 | 显示全部楼层 |阅读模式
跟着jimmy老师的"一个RNA-seq实战-超级简单-2小时搞定"做到这
dds=DESeq(dds)
res=results(dds,contrast = c("group_list","trt","untrt"))
想问如果我的实验设计有好几个水平,untreat加treat1,2,3...
这里的contrast要怎么改?
它的帮助文档说contrast只能有三个元素('contrast', as a character vector of length 3, should have the form:
contrast = c('factorName','numeratorLevel','denominatorLevel')),那我有多个实验水平该怎么办?


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