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[mRNA-seq] DEseq归一化的数据如何进行下游分析

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发表于 2021-2-6 23:08:04 | 显示全部楼层 |阅读模式
如图,GEO上作者给出的是经过DEseq用size factor归一化的counts,而DEseq2要求raw counts整数,请问各路大神,这怎么弄呢 我觉得应该很简单,但就是想半天没想明白,数据库是GSE67186
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发表于 2021-4-16 10:56:24 | 显示全部楼层
直接用线性模型就可以了,比如 limma
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发表于 2021-5-16 13:05:23 | 显示全部楼层
好帖子!!!!!!!!!
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