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[其他] 单细胞分析质控之Scrublet

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发表于 2021-6-7 17:15:41 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 菜鸟VV 于 2021-6-7 17:20 编辑

对自己的样本进行Scrublet预测双细胞,我样本的细胞数量是13984,得到的结果如下:automatically set threshold at doublet score=0.75; Detected doublet rate = 0.0%; Estimated detectable doublet fraction = 0.1% ; overall doublet rate : Expected = 10%; Estimated = 13.3% ;
结果输出预测的结果,发现预测的双细胞只有一个,请问一下大家我这个是哪里出问题了????
Scrublet的操作在https://github.com/swolock/scrub ... rublet_basics.ipynb
expected_doublet_rate=0.1其余都是默认参数
屏幕快照 2021-06-07 下午5.16.14.png
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