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[其他] DNA甲基化分析

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新手上路

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发表于 2021-6-15 10:59:51 | 显示全部楼层 |阅读模式
WGBS测序之后,使用bsmap进行回帖,然后使用自带的脚本methratio.py提取甲基化位点,请问有没有大佬指导一下之后怎么计算C的覆盖度  我统计了基因组中的C,然后发现methratio.py的结果中有的是同一个C位点有好几个结果,比如这种情况
chr1-1  506     -       CHH     0.000   4.00    0       4       0       0       0.000   0.490
chr1-1  507     -       CHH     0.000   4.00    0       4       0       0       0.000   0.490


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