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[expression-profile] geo原始数据rma后输入limma

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发表于 2021-7-18 23:56:39 | 显示全部楼层 |阅读模式
从geo数据库下载rawdata后,用oligo包读取cel文件,对数据进行rma标准化后提取表达矩阵,显示此时矩阵已被log,将此矩阵通过limma包进行差异基因分析,得出的差异基因分析结果与geo2r的分析结果相比,limma包得出的同一个基因symbol的fold change比geo2r多log一次,请问这是为什么呢,哪种方法是正确的,怎么更改呢
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