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关于二代测序数据分析结果文件备份

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发表于 2021-12-28 11:31:49 | 显示全部楼层 |阅读模式
全外显子测序数据分析,备份了去重的bam文件,未去重的有必要备份吗,未去重的bam文件有什么其他用途吗
bwa比对→samtools排序→picard去重
因为目前的流程用的不是gatk,后续想测试一下gatk,
gatk会用到未去重的bam吗,
还是只从去重的bam开始就行了
gatk对bam文件的要求有什么


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