10X scRNA-seq单样本多个run合并问题

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发表于 2022-4-25 14:15:05 | 显示全部楼层 |阅读模式

对于SRA数据库中一个样本存在多个run测序结果的情况下，如果要对不同run下的fastq合并，cellranger中aggr和fastqs指定多个目录的选择。这里是cellranger aggr的声明：

如何判断多个run是否来自同一个GEM Well呢？

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