linux 里运用 pair-end read merger （PEAR）遇到的问题

liusan

大家好，我有两个问题，1，我在bio-linux里跑PEAR时遇错：写完command，按回车，在目的文件夹里没有结果包出现，在terminal里也没有报错信息。我很困惑这是为什么？2，我之前曾经安装过不同版本的PEAR （来源不同的网站），请问我是不是应该先卸载之前安装的版本，只保留一个？


非常感谢前辈们的帮助！

PS我把bio-linux terminal的截图发上来了
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问题追加：

为什么下面的命令第一个跑不起来，第二个才能跑起来？:

1： qiime > pear –f extracted_ASeq-3_I1I2R1/barcodes.fastq.gz –r ASeq-3_S1_R2.fastq.gz –o pear_assembled_ASeq-3_I1I2R1R2

2： qiime > pear -f /home/manager/Downloads/extracted_ASeq-3_I1I2R1/barcodes.fastq.gz -r /home/manager/Downloads/ASeq-3_S1_R2.fastq.gz -o pear_assembled_ASeq-3_I1I2R1R2

Jimmy

你的第一个错误的原因是因为你没有用全路径，你去看我的博客，所有的东西都是用全路径的！

liusan

Jimmy 发表于 2017-2-10 09:17
你的第一个错误的原因是因为你没有用全路径，你去看我的博客，所有的东西都是用全路径的！ ...

谢谢Jimmy斑竹指点！