搜索
查看: 3390|回复: 6

enhancer数据库大全

[复制链接]

634

主题

1182

帖子

4030

积分

管理员

Rank: 9Rank: 9Rank: 9

积分
4030
发表于 2017-2-15 21:50:14 | 显示全部楼层 |阅读模式
简单的来说,enhance如下图所示;

复杂的统计学方法也有:
ChromHMM ( 12 ), Segway ( 13 ), RFECS ( 14 ), DEEP ( 15 ), CSI-ANN ( 16 ), EnhancerFinder ( 17 ), kmer-SVM ( 18 , 19 ) and ChroModule ( 20 )






上一篇:多组学数据联合是趋势
下一篇:表达芯片数据预处理四部曲-N,T,B,Q(normalization,transformation,bac...
你这个问题很复杂,需要打赏,请点击 http://www.bio-info-trainee.com/donate 进行打赏,谢谢
回复

使用道具 举报

634

主题

1182

帖子

4030

积分

管理员

Rank: 9Rank: 9Rank: 9

积分
4030
 楼主| 发表于 2017-2-15 21:52:49 | 显示全部楼层
你这个问题很复杂,需要打赏,请点击 http://www.bio-info-trainee.com/donate 进行打赏,谢谢
回复 支持 反对

使用道具 举报

634

主题

1182

帖子

4030

积分

管理员

Rank: 9Rank: 9Rank: 9

积分
4030
 楼主| 发表于 2017-2-15 21:53:15 | 显示全部楼层
然后看EnhancerAtlas,名字很霸气,但是数据量不多。http://enhanceratlas.org/
你这个问题很复杂,需要打赏,请点击 http://www.bio-info-trainee.com/donate 进行打赏,谢谢
回复 支持 反对

使用道具 举报

634

主题

1182

帖子

4030

积分

管理员

Rank: 9Rank: 9Rank: 9

积分
4030
 楼主| 发表于 2017-2-15 21:54:21 | 显示全部楼层
接着是 dbSUPER is the first integrated and interactive database of super-enhancers, which contains 82234 super-enhancers in 102 human and 25 mouse tissue/cell types.  
你这个问题很复杂,需要打赏,请点击 http://www.bio-info-trainee.com/donate 进行打赏,谢谢
回复 支持 反对

使用道具 举报

634

主题

1182

帖子

4030

积分

管理员

Rank: 9Rank: 9Rank: 9

积分
4030
 楼主| 发表于 2017-2-15 21:56:44 | 显示全部楼层
你这个问题很复杂,需要打赏,请点击 http://www.bio-info-trainee.com/donate 进行打赏,谢谢
回复 支持 反对

使用道具 举报

1

主题

7

帖子

270

积分

中级会员

Rank: 3Rank: 3

积分
270
发表于 2017-2-16 23:02:58 | 显示全部楼层
FANTOM5数据库里面现在也有很多各物种各细胞的enhancer的数据,最近看到一个用CAGE tags方法检测到的transcribed enhancer,有点迷惑,为什么这么关注表达转录的enhancer呢?为什么不把这些认为是noncoding RNA呢?请群主多多指点!谢谢!
回复 支持 反对

使用道具 举报

2

主题

16

帖子

147

积分

注册会员

Rank: 2

积分
147
发表于 2017-9-15 20:35:32 | 显示全部楼层
第一幅图里的promoter啥意思
回复 支持 反对

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|手机版|小黑屋|生信技能树 ( 粤ICP备15016384号  

GMT+8, 2019-10-21 01:41 , Processed in 0.044011 second(s), 25 queries .

Powered by Discuz! X3.2

© 2001-2013 Comsenz Inc.