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直接分析肿瘤转录组数据的网站-Cancer RNA-Seq Nexus

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发表于 2017-2-16 16:26:31 | 显示全部楼层 |阅读模式
直接分析肿瘤转录组数据的网站:CRN:Cancer RNA-Seq Nexus。
网址:http://syslab4.nchu.edu.tw/index.jsp

网站使用很简单,但是也需要自己摸索一段时间。
选择癌症类型,选择数据,就可以自定义分组了,差异分析,热图什么的都不在话下。

加油吧,好好体验

这个网站是2016年1月份这篇上介绍的:Cancer RNA-Seq Nexus: a database of phenotype-specific transcriptome profiling in cancer cells.Nucleic Acids Res. 2016 Jan 4;44(D1)944-51.
这个网站收录了NCBI GEO数据库和TCGA数据库的肿瘤RNA测序数据,并提供了在线分析查询工具。


包括了乳腺癌、肠癌、肝癌、肺癌等28种肿瘤,每个癌种又收录了GEO和TCGA来源的不同研究小组上传的数据




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发表于 2017-3-31 23:43:06 | 显示全部楼层
不错不错,很好玩很直观~~

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