R语言ggplot2画图系列——Pathway富集分析气泡图

dr.tanboyu · 发表于 2017-2-22 00:30:46

如题： R语言ggplot2画图系列培训——Pathway富集分析气泡图

用ggplot2来画这个气泡图，你会吗？如果你会可以试着跟帖，贴出你的代码。如果你不会你也可以跟帖写出你的心声。

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数据格式说明
1)Pathway    : 通路的名称
2)R0vsR3          ：差异表达基因中，属于这个通路的基因的数量
3)All_Unigene       ：所有基因中属于这个通路的基因的数量
4)Pvalue          ：富集分析p值
5)Qvalue             ：富集分析的Q值
6)richFactor       ：在我们分析报告中，没有提供这一列，但很容易计算。是第二列除以第三列得到；
7)Pathway ID       ：通路ID
8)Genes             ：通路中基因的ID
9)KOs                ：通路中基因的KO号
补充一点：绘图仅仅用到4类，分布是第1,2,5,6列

Alex · 发表于 2017-2-22 10:47:23

感觉非常不错，可以接受

sqsun · 发表于 2017-2-22 10:58:08

看看，好好学习一下

learnyoung · 发表于 2017-2-22 12:14:17

看看

sunqiangzai · 发表于 2017-2-22 15:38:43

看看，好好学习一下

sylvestery · 发表于 2017-2-23 09:49:30

很好，可以学习一下

321wangke321 · 发表于 2017-2-24 13:45:51

学习一下

1282548689 · 发表于 2017-2-27 17:12:45

看不懂，不知道您是怎么做出来的？

Oscarwang · 发表于 2017-3-2 10:26:38

学习下，。。。。。。。

miniaowai · 发表于 2017-3-6 18:02:04

学习希望各位大神不吝赐教

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