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R语言ggplot2画图系列——Pathway富集分析气泡图

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发表于 2017-2-22 00:30:46 | 显示全部楼层 |阅读模式


如题: R语言ggplot2画图系列培训——Pathway富集分析气泡图



用ggplot2来画这个气泡图,你会吗?如果你会可以试着跟帖,贴出你的代码。如果你不会你也可以跟帖写出你的心声。
游客,如果您要查看本帖隐藏内容请回复


数据格式说明
1)Pathway      : 通路的名称        
2)R0vsR3            :差异表达基因中,属于这个通路的基因的数量
3)All_Unigene        :所有基因中属于这个通路的基因的数量  
4)Pvalue            :富集分析p值
5)Qvalue                :富集分析的Q值
6)richFactor        :在我们分析报告中,没有提供这一列,但很容易计算。是 第二列 除以 第三列得到;
7)Pathway ID        :通路ID  
8)Genes                :通路中基因的ID
9)KOs                  :通路中基因的KO号
补充一点:绘图仅仅用到4类,分布是第1,2,5,6列

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发表于 2017-2-22 10:47:23 | 显示全部楼层
感觉非常不错,可以接受
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发表于 2017-2-22 10:58:08 | 显示全部楼层
看看,好好学习一下
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发表于 2017-2-23 09:49:30 | 显示全部楼层
很好,可以学习一下
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发表于 2017-2-23 10:37:16 | 显示全部楼层
好图,来学习下
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发表于 2017-2-24 13:45:51 | 显示全部楼层
学习一下
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发表于 2017-2-27 17:12:45 | 显示全部楼层
看不懂,不知道您是怎么做出来的?
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发表于 2017-3-2 10:26:38 | 显示全部楼层
学习下,。。。。。。。
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