R语言ggplot2画图系列——Pathway富集分析气泡图

dengfeng028 · 发表于 2020-3-25 07:08:11

学习一下

张小凡_2016 · 发表于 2020-3-28 22:35:40

学习一下写代码的方式

luoby · 发表于 2020-4-4 20:13:12

太优秀了，辛苦楼主

xiaoyanqiankun · 发表于 2020-5-12 11:02:25

学习一下，谢谢

PadLuke · 发表于 2020-6-4 18:34:09

学习啦，真的很不错，感谢

dyqggg123 · 发表于 2020-6-6 14:46:02

具体代码能给吗

北邙阳阳 · 发表于 2020-6-12 15:36:20

可以学习一下，以备不时之需

yuchengzhang86 · 发表于 2020-7-24 22:00:28

谢谢分享！！！

zwj126@163.com · 发表于 2020-7-28 11:10:42

谢谢楼主

gxsdwt · 发表于 2020-7-30 20:52:50

da<- read.delim("pathway-data.tsv")
library(ggplot2)
ggplot(da,aes(richFactor,Pathway))+
  geom_point(aes(size=R0vsR3,color=-log(Qvalue,10)))+
  scale_color_gradient(low="green",high = "red")+
  labs(color=expression(-log[10](Qvalue)),size="gene number",
   x="richFactor",y="Pathway name",title="Pathway enrichment")+
  theme_bw()

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