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[position-annotation] 关于getSYMBOL返回值为null的问题

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发表于 2017-2-28 17:40:46 | 显示全部楼层 |阅读模式
大家有没有碰到这种情况 使用getSYMBOL时,如果注释文件中symbol为“xxx///xxx////xxx”时,无法获取GeneSymbol,返回值是null 。
如何解决这种情况呢?获取“xxx///xxx////xxx”中的第一个“xxx”
谢谢!
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发表于 2017-2-28 20:00:15 | 显示全部楼层
当然得不到呀,这个函数又不是万能的,你需要用strsplit获取“xxx///xxx////xxx”中的第一个“xxx”
去好好学习R的字符串操作吧~
你这个问题很复杂,需要打赏,请点击 http://www.bio-info-trainee.com/donate 进行打赏,谢谢
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 楼主| 发表于 2017-3-4 21:26:51 | 显示全部楼层
Jimmy 发表于 2017-2-28 20:00
当然得不到呀,这个函数又不是万能的,你需要用strsplit获取“xxx///xxx////xxx”中的第一个“xxx”
去好 ...

再请教一个问题:
请问 用limma包 构建实验矩阵时  
model.matrix(~group)
model.matrix(~0+group)
model.matrix(~-1+group)
三种方法有何不同?我看了limma的guide,前两种好像是什么系数不一样(其实还是不明白),但第三种是什么意思?谢谢啦!
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发表于 2017-3-4 21:58:54 | 显示全部楼层
zhuangrui_tea 发表于 2017-3-4 21:26
再请教一个问题:
请问 用limma包 构建实验矩阵时  
model.matrix(~group)

重新发帖求组
你这个问题很复杂,需要打赏,请点击 http://www.bio-info-trainee.com/donate 进行打赏,谢谢
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 楼主| 发表于 2017-3-5 09:12:08 | 显示全部楼层

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